Mateus Fernandes é natural de Olhão e começou a jogar futebol no SC Olhanense, aos cinco anos. O seu talento não escapou ao Sporting CP, e em 2016 passou a actuar de Leão ao peito. Residente na Academia Sporting desde 2017, foi campeão nacional de iniciados em 2019, prova na qual foi determinante e na qual apontou quatro golos na fase de apuramento do campeão.
Com contrato profissional desde outubro de 2020, é internacional pela selecção nacional portuguesa nos escalões sub-18 e sub-19. No Sporting, vem subindo patamares gradualmente; estreou-se nos sub-23 no final da temporada 2020/21, na temporada passada alinhou maioritariamente na equipa B, mas também jogou na Liga Revelação e na Youth League e esta temporada terá a oportunidade de integrar o plantel principal Leonino.