Georgios Vagiannidis fez toda a formação no Panathinaikos AO, onde se estreou na equipa principal com apenas 18 anos. Acabou contratado pelo Inter de Milão em 2020, mas nunca vestiu a camisola dos italianos. Passou a temporada 20/21 por empréstimo no Sint-Truidense, da Bélgica e na temporada seguinte o Panathinaikos garantiu o seu regresso.

O ala direito é internacional A pela Grécia e reforçou a equipa do Sporting CP no verão de 2025 e garantiu que foi fácil escolher o bicampeão de Portugal, onde poderá conquistar títulos e disputar a Liga dos Campeões.